Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBG7

LY9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY9Q9HBG7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LY9Q9HBG7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LY9Q9HBG7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LY9Q9HBG7 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms