Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYX4

IFIH1, Interferon-induced helicase C domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIH1Q9BYX4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFIH1Q9BYX4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFIH1Q9BYX4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFIH1Q9BYX4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFIH1Q9BYX4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFIH1Q9BYX4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFIH1Q9BYX4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFIH1Q9BYX4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
IFIH1Q9BYX4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFIH1Q9BYX4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFIH1Q9BYX4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFIH1Q9BYX4 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
IFIH1Q9BYX4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFIH1Q9BYX4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFIH1Q9BYX4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFIH1Q9BYX4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFIH1Q9BYX4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFIH1Q9BYX4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFIH1Q9BYX4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFIH1Q9BYX4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFIH1Q9BYX4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFIH1Q9BYX4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFIH1Q9BYX4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFIH1Q9BYX4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFIH1Q9BYX4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFIH1Q9BYX4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFIH1Q9BYX4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFIH1Q9BYX4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFIH1Q9BYX4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFIH1Q9BYX4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFIH1Q9BYX4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFIH1Q9BYX4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFIH1Q9BYX4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFIH1Q9BYX4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFIH1Q9BYX4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFIH1Q9BYX4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFIH1Q9BYX4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFIH1Q9BYX4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFIH1Q9BYX4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms