Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
THUMPD2Q9BTF0 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
THUMPD2Q9BTF0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
THUMPD2Q9BTF0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
THUMPD2Q9BTF0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
THUMPD2Q9BTF0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
THUMPD2Q9BTF0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
THUMPD2Q9BTF0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
THUMPD2Q9BTF0 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
THUMPD2Q9BTF0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
THUMPD2Q9BTF0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
THUMPD2Q9BTF0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
THUMPD2Q9BTF0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
THUMPD2Q9BTF0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
THUMPD2Q9BTF0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
THUMPD2Q9BTF0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
THUMPD2Q9BTF0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
THUMPD2Q9BTF0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
THUMPD2Q9BTF0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
THUMPD2Q9BTF0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
THUMPD2Q9BTF0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
THUMPD2Q9BTF0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
THUMPD2Q9BTF0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
THUMPD2Q9BTF0 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
THUMPD2Q9BTF0 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
THUMPD2Q9BTF0 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
THUMPD2Q9BTF0 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
THUMPD2Q9BTF0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
THUMPD2Q9BTF0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
THUMPD2Q9BTF0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
THUMPD2Q9BTF0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
THUMPD2Q9BTF0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
THUMPD2Q9BTF0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
THUMPD2Q9BTF0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
THUMPD2Q9BTF0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
THUMPD2Q9BTF0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
THUMPD2Q9BTF0 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
THUMPD2Q9BTF0 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
THUMPD2Q9BTF0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
THUMPD2Q9BTF0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
THUMPD2Q9BTF0 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
THUMPD2Q9BTF0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
THUMPD2Q9BTF0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
THUMPD2Q9BTF0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
THUMPD2Q9BTF0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
THUMPD2Q9BTF0 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
THUMPD2Q9BTF0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
THUMPD2Q9BTF0 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
THUMPD2Q9BTF0 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
THUMPD2Q9BTF0 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
THUMPD2Q9BTF0 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
THUMPD2Q9BTF0 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
THUMPD2Q9BTF0 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
THUMPD2Q9BTF0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
THUMPD2Q9BTF0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
THUMPD2Q9BTF0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
THUMPD2Q9BTF0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
THUMPD2Q9BTF0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
THUMPD2Q9BTF0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
THUMPD2Q9BTF0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
THUMPD2Q9BTF0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
THUMPD2Q9BTF0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
THUMPD2Q9BTF0 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
THUMPD2Q9BTF0 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
THUMPD2Q9BTF0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
THUMPD2Q9BTF0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
THUMPD2Q9BTF0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
THUMPD2Q9BTF0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
THUMPD2Q9BTF0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
THUMPD2Q9BTF0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
THUMPD2Q9BTF0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
THUMPD2Q9BTF0 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
THUMPD2Q9BTF0 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
THUMPD2Q9BTF0 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
THUMPD2Q9BTF0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
THUMPD2Q9BTF0 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
THUMPD2Q9BTF0 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
THUMPD2Q9BTF0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
THUMPD2Q9BTF0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
THUMPD2Q9BTF0 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
THUMPD2Q9BTF0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
THUMPD2Q9BTF0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
THUMPD2Q9BTF0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
THUMPD2Q9BTF0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
THUMPD2Q9BTF0 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
THUMPD2Q9BTF0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
THUMPD2Q9BTF0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
THUMPD2Q9BTF0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
THUMPD2Q9BTF0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
THUMPD2Q9BTF0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
THUMPD2Q9BTF0 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
THUMPD2Q9BTF0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
THUMPD2Q9BTF0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
THUMPD2Q9BTF0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
THUMPD2Q9BTF0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
THUMPD2Q9BTF0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
THUMPD2Q9BTF0 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
THUMPD2Q9BTF0 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
THUMPD2Q9BTF0 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
THUMPD2Q9BTF0 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms