Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RTKNQ9BST9 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms