Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR77

CCDC77, Coiled-coil domain-containing protein 77, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC77Q9BR77 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC77Q9BR77 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC77Q9BR77 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms