Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC9Q96Q05 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms