Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU9

ODF3, Outer dense fiber protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3Q96PU9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF3Q96PU9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms