Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC12Q8WUD4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms