Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KLHDC4Q8TBB5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KLHDC4Q8TBB5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KLHDC4Q8TBB5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KLHDC4Q8TBB5 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KLHDC4Q8TBB5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KLHDC4Q8TBB5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KLHDC4Q8TBB5 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
KLHDC4Q8TBB5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
KLHDC4Q8TBB5 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KLHDC4Q8TBB5 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KLHDC4Q8TBB5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KLHDC4Q8TBB5 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KLHDC4Q8TBB5 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KLHDC4Q8TBB5 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KLHDC4Q8TBB5 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KLHDC4Q8TBB5 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KLHDC4Q8TBB5 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KLHDC4Q8TBB5 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KLHDC4Q8TBB5 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KLHDC4Q8TBB5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KLHDC4Q8TBB5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KLHDC4Q8TBB5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KLHDC4Q8TBB5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KLHDC4Q8TBB5 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KLHDC4Q8TBB5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KLHDC4Q8TBB5 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KLHDC4Q8TBB5 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KLHDC4Q8TBB5 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KLHDC4Q8TBB5 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
KLHDC4Q8TBB5 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KLHDC4Q8TBB5 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KLHDC4Q8TBB5 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KLHDC4Q8TBB5 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KLHDC4Q8TBB5 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KLHDC4Q8TBB5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KLHDC4Q8TBB5 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KLHDC4Q8TBB5 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KLHDC4Q8TBB5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KLHDC4Q8TBB5 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KLHDC4Q8TBB5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KLHDC4Q8TBB5 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KLHDC4Q8TBB5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KLHDC4Q8TBB5 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KLHDC4Q8TBB5 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KLHDC4Q8TBB5 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KLHDC4Q8TBB5 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KLHDC4Q8TBB5 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KLHDC4Q8TBB5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KLHDC4Q8TBB5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KLHDC4Q8TBB5 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KLHDC4Q8TBB5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KLHDC4Q8TBB5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KLHDC4Q8TBB5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KLHDC4Q8TBB5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KLHDC4Q8TBB5 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KLHDC4Q8TBB5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KLHDC4Q8TBB5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KLHDC4Q8TBB5 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KLHDC4Q8TBB5 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KLHDC4Q8TBB5 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KLHDC4Q8TBB5 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KLHDC4Q8TBB5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
KLHDC4Q8TBB5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KLHDC4Q8TBB5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KLHDC4Q8TBB5 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHDC4Q8TBB5 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHDC4Q8TBB5 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHDC4Q8TBB5 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHDC4Q8TBB5 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHDC4Q8TBB5 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHDC4Q8TBB5 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHDC4Q8TBB5 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHDC4Q8TBB5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHDC4Q8TBB5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHDC4Q8TBB5 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
KLHDC4Q8TBB5 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KLHDC4Q8TBB5 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
KLHDC4Q8TBB5 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KLHDC4Q8TBB5 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KLHDC4Q8TBB5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KLHDC4Q8TBB5 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KLHDC4Q8TBB5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KLHDC4Q8TBB5 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KLHDC4Q8TBB5 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KLHDC4Q8TBB5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KLHDC4Q8TBB5 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KLHDC4Q8TBB5 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KLHDC4Q8TBB5 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KLHDC4Q8TBB5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KLHDC4Q8TBB5 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KLHDC4Q8TBB5 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
KLHDC4Q8TBB5 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
KLHDC4Q8TBB5 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KLHDC4Q8TBB5 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KLHDC4Q8TBB5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KLHDC4Q8TBB5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
KLHDC4Q8TBB5 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KLHDC4Q8TBB5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
KLHDC4Q8TBB5 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms