Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH1

TTLL11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11Q8NHH1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTLL11Q8NHH1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTLL11Q8NHH1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTLL11Q8NHH1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTLL11Q8NHH1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTLL11Q8NHH1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTLL11Q8NHH1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTLL11Q8NHH1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTLL11Q8NHH1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTLL11Q8NHH1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTLL11Q8NHH1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTLL11Q8NHH1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTLL11Q8NHH1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTLL11Q8NHH1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TTLL11Q8NHH1 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TTLL11Q8NHH1 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TTLL11Q8NHH1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTLL11Q8NHH1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTLL11Q8NHH1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTLL11Q8NHH1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTLL11Q8NHH1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTLL11Q8NHH1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTLL11Q8NHH1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTLL11Q8NHH1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTLL11Q8NHH1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTLL11Q8NHH1 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTLL11Q8NHH1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTLL11Q8NHH1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTLL11Q8NHH1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTLL11Q8NHH1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTLL11Q8NHH1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTLL11Q8NHH1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTLL11Q8NHH1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTLL11Q8NHH1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTLL11Q8NHH1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTLL11Q8NHH1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTLL11Q8NHH1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTLL11Q8NHH1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTLL11Q8NHH1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTLL11Q8NHH1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTLL11Q8NHH1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTLL11Q8NHH1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTLL11Q8NHH1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TTLL11Q8NHH1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TTLL11Q8NHH1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTLL11Q8NHH1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTLL11Q8NHH1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTLL11Q8NHH1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTLL11Q8NHH1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTLL11Q8NHH1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTLL11Q8NHH1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTLL11Q8NHH1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTLL11Q8NHH1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTLL11Q8NHH1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TTLL11Q8NHH1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTLL11Q8NHH1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTLL11Q8NHH1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTLL11Q8NHH1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTLL11Q8NHH1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTLL11Q8NHH1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TTLL11Q8NHH1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTLL11Q8NHH1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTLL11Q8NHH1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTLL11Q8NHH1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTLL11Q8NHH1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTLL11Q8NHH1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TTLL11Q8NHH1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTLL11Q8NHH1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTLL11Q8NHH1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTLL11Q8NHH1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTLL11Q8NHH1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTLL11Q8NHH1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTLL11Q8NHH1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TTLL11Q8NHH1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTLL11Q8NHH1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTLL11Q8NHH1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTLL11Q8NHH1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTLL11Q8NHH1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTLL11Q8NHH1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TTLL11Q8NHH1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TTLL11Q8NHH1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTLL11Q8NHH1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTLL11Q8NHH1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTLL11Q8NHH1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTLL11Q8NHH1 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTLL11Q8NHH1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTLL11Q8NHH1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTLL11Q8NHH1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTLL11Q8NHH1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTLL11Q8NHH1 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTLL11Q8NHH1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTLL11Q8NHH1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTLL11Q8NHH1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTLL11Q8NHH1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTLL11Q8NHH1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTLL11Q8NHH1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTLL11Q8NHH1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TTLL11Q8NHH1 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TTLL11Q8NHH1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTLL11Q8NHH1 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms