Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU1

BEST2, Bestrophin-2, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST2Q8NFU1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BEST2Q8NFU1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms