Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG16L2Q8NAA4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG16L2Q8NAA4 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG16L2Q8NAA4 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG16L2Q8NAA4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG16L2Q8NAA4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG16L2Q8NAA4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG16L2Q8NAA4 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG16L2Q8NAA4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG16L2Q8NAA4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG16L2Q8NAA4 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG16L2Q8NAA4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATG16L2Q8NAA4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG16L2Q8NAA4 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG16L2Q8NAA4 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG16L2Q8NAA4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG16L2Q8NAA4 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG16L2Q8NAA4 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG16L2Q8NAA4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG16L2Q8NAA4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG16L2Q8NAA4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG16L2Q8NAA4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG16L2Q8NAA4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG16L2Q8NAA4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG16L2Q8NAA4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG16L2Q8NAA4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG16L2Q8NAA4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG16L2Q8NAA4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ATG16L2Q8NAA4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG16L2Q8NAA4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms