Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATL3Q6DD88 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATL3Q6DD88 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms