Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms