Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB6CQ53S08 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB6CQ53S08 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms