Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ECM1Q16610 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ECM1Q16610 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ECM1Q16610 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ECM1Q16610 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ECM1Q16610 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ECM1Q16610 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ECM1Q16610 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ECM1Q16610 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ECM1Q16610 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ECM1Q16610 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ECM1Q16610 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ECM1Q16610 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ECM1Q16610 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ECM1Q16610 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ECM1Q16610 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ECM1Q16610 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ECM1Q16610 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ECM1Q16610 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ECM1Q16610 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ECM1Q16610 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ECM1Q16610 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ECM1Q16610 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ECM1Q16610 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ECM1Q16610 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ECM1Q16610 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ECM1Q16610 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ECM1Q16610 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ECM1Q16610 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ECM1Q16610 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ECM1Q16610 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ECM1Q16610 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ECM1Q16610 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ECM1Q16610 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ECM1Q16610 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ECM1Q16610 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ECM1Q16610 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ECM1Q16610 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ECM1Q16610 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ECM1Q16610 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ECM1Q16610 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ECM1Q16610 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ECM1Q16610 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ECM1Q16610 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ECM1Q16610 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ECM1Q16610 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ECM1Q16610 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ECM1Q16610 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ECM1Q16610 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ECM1Q16610 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ECM1Q16610 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ECM1Q16610 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ECM1Q16610 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ECM1Q16610 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ECM1Q16610 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ECM1Q16610 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ECM1Q16610 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ECM1Q16610 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ECM1Q16610 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ECM1Q16610 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
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