Protein–RNA interactions for Protein: Q15629

TRAM1, Translocating chain-associated membrane protein 1, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM1Q15629 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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TRAM1Q15629 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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TRAM1Q15629 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAM1Q15629 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms