Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.123e-6■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 DGKZ-215ENST00000528173 5737 ntTSL 515.66■□□□□ 0.13e-6■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 DGKZ-217ENST00000529660 493 ntTSL 515.61■□□□□ 0.093e-6■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 DGKZ-204ENST00000454345 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.223e-6■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 DGKZ-216ENST00000528615 2692 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.263e-6■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 DGKZ-219ENST00000531879 2922 ntTSL 213.17□□□□□ -0.33e-6■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 DGKZ-220ENST00000532868 3118 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.373e-6■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 DGKZ-208ENST00000524984 3512 ntTSL 212.77□□□□□ -0.373e-6■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 DGKZ-211ENST00000527211 3679 ntTSL 1 (best)11.94□□□□□ -0.53e-6■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 SLC25A23-211ENST00000600682 1210 ntTSL 216.17■□□□□ 0.182e-7■■■■□ 21.8
PCBP1Q15365 CIC-209ENST00000576505 1304 ntTSL 319.82■□□□□ 0.764e-6■■■■□ 21.7
PCBP1Q15365 ESYT2-202ENST00000275418 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 520.11■□□□□ 0.815e-19■■■■□ 21.7
PCBP1Q15365 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.775e-19■■■■□ 21.7
PCBP1Q15365 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.355e-19■■■■□ 21.7
PCBP1Q15365 ESYT2-205ENST00000497111 663 ntTSL 417.07■□□□□ 0.325e-19■■■■□ 21.7
PCBP1Q15365 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.481e-7■■■■□ 21.7
PCBP1Q15365 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.381e-7■■■■□ 21.7
PCBP1Q15365 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.31e-7■■■■□ 21.7
PCBP1Q15365 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.131e-7■■■■□ 21.7
PCBP1Q15365 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.081e-7■■■■□ 21.7
PCBP1Q15365 PRSS21-204ENST00000570629 626 ntTSL 213.71□□□□□ -0.213e-6■■■■□ 21.7
PCBP1Q15365 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.722e-6■■■■□ 21.7
PCBP1Q15365 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.282e-6■■■■□ 21.7
PCBP1Q15365 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.332e-6■■■■□ 21.7
PCBP1Q15365 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.813e-6■■■■□ 21.7
PCBP1Q15365 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.73e-6■■■■□ 21.7
PCBP1Q15365 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.053e-6■■■■□ 21.7
PCBP1Q15365 CRACR2B-211ENST00000530737 834 ntTSL 319.88■□□□□ 0.773e-6■■■■□ 21.7
PCBP1Q15365 CRACR2B-213ENST00000534191 1154 ntTSL 217.43■□□□□ 0.383e-6■■■■□ 21.7
PCBP1Q15365 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.151e-8■■■■□ 21.7
PCBP1Q15365 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.061e-8■■■■□ 21.7
PCBP1Q15365 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.691e-8■■■■□ 21.7
PCBP1Q15365 AGAP3-226ENST00000622464 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.251e-8■■■■□ 21.7
PCBP1Q15365 AGAP3-205ENST00000463381 2730 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.341e-8■■■■□ 21.7
PCBP1Q15365 NPRL3-213ENST00000621703 2812 ntTSL 1 (best)16.95■□□□□ 0.31e-6■■■■□ 21.6
PCBP1Q15365 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.271e-6■■■■□ 21.6
PCBP1Q15365 NPRL3-214ENST00000622194 2981 ntTSL 516.51■□□□□ 0.231e-6■■■■□ 21.6
PCBP1Q15365 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.171e-6■■■■□ 21.6
PCBP1Q15365 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.051e-6■■■■□ 21.6
PCBP1Q15365 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.872e-6■■■■□ 21.6
PCBP1Q15365 PFKL-211ENST00000498841 3122 ntTSL 1 (best)16.94■□□□□ 0.31e-7■■■■□ 21.6
PCBP1Q15365 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.476e-7■■■■□ 21.6
PCBP1Q15365 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.796e-7■■■■□ 21.6
PCBP1Q15365 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.396e-7■■■■□ 21.6
PCBP1Q15365 RPUSD3-203ENST00000423108 756 ntTSL 213.81□□□□□ -0.26e-7■■■■□ 21.6
PCBP1Q15365 RPUSD3-211ENST00000464783 1149 ntTSL 213.3□□□□□ -0.286e-7■■■■□ 21.6
PCBP1Q15365 RPUSD3-212ENST00000466141 996 ntTSL 27.72□□□□□ -1.176e-7■■■■□ 21.6
PCBP1Q15365 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.321e-6■■■■□ 21.6
PCBP1Q15365 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.562e-6■■■■□ 21.6
PCBP1Q15365 SLC35C1-204ENST00000530471 695 ntTSL 323.06■■□□□ 1.282e-6■■■■□ 21.6
PCBP1Q15365 SLC35C1-203ENST00000526817 582 ntTSL 221.53■■□□□ 1.042e-6■■■■□ 21.6
PCBP1Q15365 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.022e-6■■■■□ 21.6
PCBP1Q15365 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.433e-7■■■■□ 21.6
PCBP1Q15365 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.225e-7■■■■□ 21.5
PCBP1Q15365 FOXN3-211ENST00000555855 851 ntTSL 521.67■■□□□ 1.065e-7■■■■□ 21.5
PCBP1Q15365 HPN-208ENST00000600390 564 ntTSL 421.11■□□□□ 0.972e-6■■■■□ 21.5
PCBP1Q15365 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.836e-14■■■■□ 21.5
PCBP1Q15365 GRB7-208ENST00000485182 879 ntTSL 218.71■□□□□ 0.596e-14■■■■□ 21.5
PCBP1Q15365 GRB7-212ENST00000584053 584 ntTSL 418.48■□□□□ 0.556e-14■■■■□ 21.5
PCBP1Q15365 GRB7-209ENST00000577695 612 ntTSL 516.4■□□□□ 0.226e-14■■■■□ 21.5
PCBP1Q15365 GRB7-211ENST00000583813 560 ntTSL 416.32■□□□□ 0.26e-14■■■■□ 21.5
PCBP1Q15365 GRB7-213ENST00000584819 1146 ntTSL 216.19■□□□□ 0.186e-14■■■■□ 21.5
PCBP1Q15365 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.116e-14■■■■□ 21.5
PCBP1Q15365 GRB7-210ENST00000578702 630 ntTSL 315.01□□□□□ -0.016e-14■■■■□ 21.5
PCBP1Q15365 FOXN3-202ENST00000345097 7832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.955e-7■■■■□ 21.5
PCBP1Q15365 FCGRT-209ENST00000596147 383 ntTSL 319.26■□□□□ 0.671e-6■■■■□ 21.5
PCBP1Q15365 FCGRT-206ENST00000594823 819 ntTSL 516.92■□□□□ 0.31e-6■■■■□ 21.5
PCBP1Q15365 FOXK1-202ENST00000460979 758 ntTSL 219.71■□□□□ 0.752e-6■■■■□ 21.5
PCBP1Q15365 SEMA4G-211ENST00000521006 4656 ntTSL 1 (best)13.83□□□□□ -0.25e-7■■■■□ 21.5
PCBP1Q15365 PLP2-202ENST00000376327 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.383e-9■■■■□ 21.5
PCBP1Q15365 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 21e-8■■■■□ 21.4
PCBP1Q15365 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.511e-8■■■■□ 21.4
PCBP1Q15365 MED12-203ENST00000374102 6827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.577e-6■■■■□ 21.4
PCBP1Q15365 MED12-201ENST00000333646 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.897e-6■■■■□ 21.4
PCBP1Q15365 MED12-202ENST00000374080 6795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.077e-6■■■■□ 21.4
PCBP1Q15365 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.139e-9■■■■□ 21.4
PCBP1Q15365 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.449e-9■■■■□ 21.4
PCBP1Q15365 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.44■□□□□ 0.229e-9■■■■□ 21.4
PCBP1Q15365 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.059e-9■■■■□ 21.4
PCBP1Q15365 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.039e-9■■■■□ 21.4
PCBP1Q15365 MICALL2-210ENST00000482839 852 ntTSL 216.93■□□□□ 0.39e-9■■■■□ 21.4
PCBP1Q15365 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.741e-8■■■■□ 21.4
PCBP1Q15365 CARM1-203ENST00000586221 2766 ntTSL 1 (best)16.05■□□□□ 0.161e-8■■■■□ 21.4
PCBP1Q15365 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.192e-6■■■■□ 21.4
PCBP1Q15365 HDLBP-220ENST00000442730 683 ntTSL 224.58■■□□□ 1.534e-7■■■■□ 21.3
PCBP1Q15365 HDLBP-240ENST00000484412 669 ntTSL 515.59■□□□□ 0.094e-7■■■■□ 21.3
PCBP1Q15365 HDLBP-245ENST00000494862 356 ntTSL 212.38□□□□□ -0.434e-7■■■■□ 21.3
PCBP1Q15365 PKP4-209ENST00000479398 550 ntTSL 522.99■■□□□ 1.276e-6■■■■□ 21.3
PCBP1Q15365 PKP4-205ENST00000426248 4134 ntTSL 1 (best)16.31■□□□□ 0.26e-6■■■■□ 21.3
PCBP1Q15365 PKP4-206ENST00000452162 2359 ntTSL 1 (best)11.28□□□□□ -0.66e-6■■■■□ 21.3
PCBP1Q15365 PKP4-203ENST00000411900 552 ntTSL 411.12□□□□□ -0.636e-6■■■■□ 21.3
PCBP1Q15365 PKP4-201ENST00000389757 5777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.76e-6■■■■□ 21.3
PCBP1Q15365 PKP4-207ENST00000457109 520 ntTSL 39.85□□□□□ -0.836e-6■■■■□ 21.3
PCBP1Q15365 PKP4-202ENST00000389759 4443 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.036e-6■■■■□ 21.3
PCBP1Q15365 PKP4-217ENST00000628904 3856 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.26e-6■■■■□ 21.3
PCBP1Q15365 HBG2-204ENST00000444587 307 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.224e-28■■■■□ 21.3
PCBP1Q15365 LENG8-203ENST00000421200 594 ntTSL 316.1■□□□□ 0.172e-10■■■■□ 21.3
PCBP1Q15365 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.051e-7■■■■□ 21.3
PCBP1Q15365 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.951e-7■■■■□ 21.3
PCBP1Q15365 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.81e-7■■■■□ 21.3
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