Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BECN1Q14457 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
BECN1Q14457 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BECN1Q14457 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BECN1Q14457 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
BECN1Q14457 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
BECN1Q14457 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BECN1Q14457 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BECN1Q14457 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BECN1Q14457 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BECN1Q14457 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BECN1Q14457 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BECN1Q14457 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BECN1Q14457 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BECN1Q14457 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BECN1Q14457 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BECN1Q14457 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BECN1Q14457 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BECN1Q14457 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BECN1Q14457 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BECN1Q14457 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BECN1Q14457 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BECN1Q14457 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BECN1Q14457 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BECN1Q14457 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BECN1Q14457 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BECN1Q14457 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BECN1Q14457 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BECN1Q14457 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BECN1Q14457 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BECN1Q14457 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BECN1Q14457 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BECN1Q14457 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
BECN1Q14457 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BECN1Q14457 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BECN1Q14457 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
BECN1Q14457 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
BECN1Q14457 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
BECN1Q14457 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
BECN1Q14457 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
BECN1Q14457 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BECN1Q14457 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BECN1Q14457 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BECN1Q14457 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BECN1Q14457 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BECN1Q14457 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BECN1Q14457 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BECN1Q14457 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BECN1Q14457 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BECN1Q14457 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BECN1Q14457 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BECN1Q14457 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BECN1Q14457 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BECN1Q14457 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BECN1Q14457 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BECN1Q14457 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
BECN1Q14457 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
BECN1Q14457 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BECN1Q14457 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BECN1Q14457 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BECN1Q14457 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BECN1Q14457 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BECN1Q14457 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BECN1Q14457 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BECN1Q14457 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BECN1Q14457 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BECN1Q14457 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BECN1Q14457 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BECN1Q14457 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BECN1Q14457 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BECN1Q14457 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BECN1Q14457 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BECN1Q14457 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
BECN1Q14457 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BECN1Q14457 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BECN1Q14457 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
BECN1Q14457 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
BECN1Q14457 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BECN1Q14457 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BECN1Q14457 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BECN1Q14457 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BECN1Q14457 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BECN1Q14457 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BECN1Q14457 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BECN1Q14457 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BECN1Q14457 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BECN1Q14457 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BECN1Q14457 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BECN1Q14457 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BECN1Q14457 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BECN1Q14457 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BECN1Q14457 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BECN1Q14457 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
BECN1Q14457 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BECN1Q14457 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BECN1Q14457 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BECN1Q14457 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BECN1Q14457 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BECN1Q14457 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BECN1Q14457 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
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