Protein–RNA interactions for Protein: Q14088

RAB33A, Ras-related protein Rab-33A, humanhuman

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB33AQ14088 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB33AQ14088 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB33AQ14088 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB33AQ14088 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB33AQ14088 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB33AQ14088 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB33AQ14088 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB33AQ14088 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB33AQ14088 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB33AQ14088 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
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