Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
PRDM2Q13029 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
PRDM2Q13029 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
PRDM2Q13029 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
PRDM2Q13029 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
PRDM2Q13029 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
PRDM2Q13029 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
PRDM2Q13029 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
PRDM2Q13029 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
PRDM2Q13029 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC35.76■■■■□ 3.31
PRDM2Q13029 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC35.76■■■■□ 3.31
PRDM2Q13029 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
PRDM2Q13029 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
PRDM2Q13029 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
PRDM2Q13029 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
PRDM2Q13029 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
PRDM2Q13029 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
PRDM2Q13029 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
PRDM2Q13029 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
PRDM2Q13029 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
PRDM2Q13029 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
PRDM2Q13029 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
PRDM2Q13029 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
PRDM2Q13029 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC35.74■■■■□ 3.31
PRDM2Q13029 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
PRDM2Q13029 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
PRDM2Q13029 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
PRDM2Q13029 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC35.73■■■■□ 3.31
PRDM2Q13029 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
PRDM2Q13029 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
PRDM2Q13029 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
PRDM2Q13029 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
PRDM2Q13029 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC35.72■■■■□ 3.31
PRDM2Q13029 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
PRDM2Q13029 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
PRDM2Q13029 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
PRDM2Q13029 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
PRDM2Q13029 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
PRDM2Q13029 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
PRDM2Q13029 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
PRDM2Q13029 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
PRDM2Q13029 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
PRDM2Q13029 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
PRDM2Q13029 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
PRDM2Q13029 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
PRDM2Q13029 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
PRDM2Q13029 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
PRDM2Q13029 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
PRDM2Q13029 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.71■■■■□ 3.31
PRDM2Q13029 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
PRDM2Q13029 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
PRDM2Q13029 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
PRDM2Q13029 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
PRDM2Q13029 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
PRDM2Q13029 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
PRDM2Q13029 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
PRDM2Q13029 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
PRDM2Q13029 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
PRDM2Q13029 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
PRDM2Q13029 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
PRDM2Q13029 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
PRDM2Q13029 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
PRDM2Q13029 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
PRDM2Q13029 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
PRDM2Q13029 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
PRDM2Q13029 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
PRDM2Q13029 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
PRDM2Q13029 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
PRDM2Q13029 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
PRDM2Q13029 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
PRDM2Q13029 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
PRDM2Q13029 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
PRDM2Q13029 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
PRDM2Q13029 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
PRDM2Q13029 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
PRDM2Q13029 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
PRDM2Q13029 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
PRDM2Q13029 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
PRDM2Q13029 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
PRDM2Q13029 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
PRDM2Q13029 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
PRDM2Q13029 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
PRDM2Q13029 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
PRDM2Q13029 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
PRDM2Q13029 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
PRDM2Q13029 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
PRDM2Q13029 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC35.67■■■■□ 3.3
PRDM2Q13029 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
PRDM2Q13029 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
PRDM2Q13029 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
PRDM2Q13029 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
PRDM2Q13029 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
PRDM2Q13029 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
PRDM2Q13029 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
PRDM2Q13029 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
PRDM2Q13029 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
PRDM2Q13029 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
PRDM2Q13029 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
PRDM2Q13029 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
PRDM2Q13029 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms