Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GBE1Q04446 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GBE1Q04446 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GBE1Q04446 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GBE1Q04446 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GBE1Q04446 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GBE1Q04446 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GBE1Q04446 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GBE1Q04446 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GBE1Q04446 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GBE1Q04446 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GBE1Q04446 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GBE1Q04446 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GBE1Q04446 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GBE1Q04446 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GBE1Q04446 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GBE1Q04446 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GBE1Q04446 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GBE1Q04446 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GBE1Q04446 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GBE1Q04446 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GBE1Q04446 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GBE1Q04446 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GBE1Q04446 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GBE1Q04446 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
GBE1Q04446 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
GBE1Q04446 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GBE1Q04446 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GBE1Q04446 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GBE1Q04446 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GBE1Q04446 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GBE1Q04446 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GBE1Q04446 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GBE1Q04446 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GBE1Q04446 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GBE1Q04446 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GBE1Q04446 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GBE1Q04446 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
GBE1Q04446 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GBE1Q04446 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GBE1Q04446 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GBE1Q04446 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GBE1Q04446 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GBE1Q04446 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GBE1Q04446 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GBE1Q04446 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GBE1Q04446 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GBE1Q04446 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GBE1Q04446 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GBE1Q04446 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GBE1Q04446 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GBE1Q04446 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GBE1Q04446 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GBE1Q04446 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GBE1Q04446 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GBE1Q04446 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GBE1Q04446 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
GBE1Q04446 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GBE1Q04446 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GBE1Q04446 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GBE1Q04446 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GBE1Q04446 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GBE1Q04446 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GBE1Q04446 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GBE1Q04446 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GBE1Q04446 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GBE1Q04446 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GBE1Q04446 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GBE1Q04446 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GBE1Q04446 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GBE1Q04446 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GBE1Q04446 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GBE1Q04446 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GBE1Q04446 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GBE1Q04446 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GBE1Q04446 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GBE1Q04446 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GBE1Q04446 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GBE1Q04446 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GBE1Q04446 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GBE1Q04446 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GBE1Q04446 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GBE1Q04446 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GBE1Q04446 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GBE1Q04446 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GBE1Q04446 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
GBE1Q04446 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GBE1Q04446 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GBE1Q04446 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GBE1Q04446 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GBE1Q04446 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GBE1Q04446 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GBE1Q04446 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GBE1Q04446 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GBE1Q04446 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GBE1Q04446 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GBE1Q04446 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GBE1Q04446 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GBE1Q04446 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms