Protein–RNA interactions for Protein: P59666

DEFA3, Neutrophil defensin 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA3P59666 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
DEFA3P59666 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
DEFA3P59666 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEFA3P59666 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEFA3P59666 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEFA3P59666 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEFA3P59666 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEFA3P59666 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEFA3P59666 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEFA3P59666 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEFA3P59666 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEFA3P59666 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEFA3P59666 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEFA3P59666 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEFA3P59666 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DEFA3P59666 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEFA3P59666 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEFA3P59666 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEFA3P59666 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEFA3P59666 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEFA3P59666 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEFA3P59666 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEFA3P59666 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEFA3P59666 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEFA3P59666 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEFA3P59666 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEFA3P59666 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEFA3P59666 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEFA3P59666 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DEFA3P59666 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DEFA3P59666 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DEFA3P59666 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DEFA3P59666 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DEFA3P59666 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DEFA3P59666 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DEFA3P59666 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DEFA3P59666 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DEFA3P59666 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DEFA3P59666 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DEFA3P59666 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DEFA3P59666 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DEFA3P59666 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DEFA3P59666 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DEFA3P59666 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DEFA3P59666 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DEFA3P59666 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DEFA3P59666 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DEFA3P59666 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DEFA3P59666 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DEFA3P59666 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DEFA3P59666 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DEFA3P59666 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DEFA3P59666 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEFA3P59666 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEFA3P59666 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEFA3P59666 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEFA3P59666 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEFA3P59666 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms