Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLTPP55058 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLTPP55058 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLTPP55058 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLTPP55058 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLTPP55058 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLTPP55058 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLTPP55058 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLTPP55058 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLTPP55058 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLTPP55058 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLTPP55058 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLTPP55058 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PLTPP55058 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLTPP55058 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLTPP55058 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLTPP55058 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLTPP55058 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLTPP55058 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLTPP55058 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLTPP55058 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLTPP55058 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLTPP55058 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLTPP55058 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLTPP55058 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLTPP55058 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLTPP55058 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLTPP55058 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLTPP55058 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLTPP55058 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLTPP55058 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLTPP55058 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLTPP55058 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLTPP55058 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLTPP55058 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PLTPP55058 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLTPP55058 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLTPP55058 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLTPP55058 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLTPP55058 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLTPP55058 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLTPP55058 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PLTPP55058 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLTPP55058 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLTPP55058 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLTPP55058 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLTPP55058 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLTPP55058 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLTPP55058 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLTPP55058 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLTPP55058 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLTPP55058 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLTPP55058 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLTPP55058 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLTPP55058 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLTPP55058 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLTPP55058 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLTPP55058 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLTPP55058 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLTPP55058 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLTPP55058 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLTPP55058 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLTPP55058 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PLTPP55058 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PLTPP55058 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PLTPP55058 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PLTPP55058 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PLTPP55058 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PLTPP55058 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PLTPP55058 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PLTPP55058 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PLTPP55058 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PLTPP55058 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PLTPP55058 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PLTPP55058 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PLTPP55058 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PLTPP55058 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PLTPP55058 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PLTPP55058 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PLTPP55058 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PLTPP55058 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PLTPP55058 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PLTPP55058 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PLTPP55058 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PLTPP55058 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PLTPP55058 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PLTPP55058 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PLTPP55058 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLTPP55058 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLTPP55058 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLTPP55058 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PLTPP55058 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PLTPP55058 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLTPP55058 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLTPP55058 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLTPP55058 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLTPP55058 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLTPP55058 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLTPP55058 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PLTPP55058 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms