Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUP98P52948 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUP98P52948 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUP98P52948 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUP98P52948 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUP98P52948 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUP98P52948 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP98P52948 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP98P52948 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP98P52948 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP98P52948 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP98P52948 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP98P52948 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP98P52948 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP98P52948 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP98P52948 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP98P52948 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP98P52948 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP98P52948 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP98P52948 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP98P52948 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP98P52948 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP98P52948 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUP98P52948 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NUP98P52948 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUP98P52948 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUP98P52948 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUP98P52948 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUP98P52948 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUP98P52948 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUP98P52948 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUP98P52948 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUP98P52948 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP98P52948 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP98P52948 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP98P52948 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP98P52948 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP98P52948 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP98P52948 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP98P52948 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP98P52948 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP98P52948 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP98P52948 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP98P52948 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP98P52948 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP98P52948 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP98P52948 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP98P52948 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP98P52948 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP98P52948 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP98P52948 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP98P52948 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP98P52948 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP98P52948 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP98P52948 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP98P52948 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP98P52948 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP98P52948 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP98P52948 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP98P52948 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP98P52948 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP98P52948 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP98P52948 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP98P52948 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP98P52948 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP98P52948 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP98P52948 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP98P52948 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP98P52948 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP98P52948 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP98P52948 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUP98P52948 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUP98P52948 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUP98P52948 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUP98P52948 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NUP98P52948 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NUP98P52948 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUP98P52948 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUP98P52948 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUP98P52948 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP98P52948 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP98P52948 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP98P52948 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP98P52948 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP98P52948 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP98P52948 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP98P52948 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP98P52948 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP98P52948 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP98P52948 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP98P52948 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP98P52948 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP98P52948 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP98P52948 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP98P52948 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP98P52948 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP98P52948 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP98P52948 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
NUP98P52948 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUP98P52948 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms