Protein–RNA interactions for Protein: P52815

MRPL12, 39S ribosomal protein L12, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL12P52815 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MRPL12P52815 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MRPL12P52815 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MRPL12P52815 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MRPL12P52815 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MRPL12P52815 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MRPL12P52815 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MRPL12P52815 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MRPL12P52815 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MRPL12P52815 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MRPL12P52815 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MRPL12P52815 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MRPL12P52815 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MRPL12P52815 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MRPL12P52815 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MRPL12P52815 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MRPL12P52815 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MRPL12P52815 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MRPL12P52815 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MRPL12P52815 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MRPL12P52815 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MRPL12P52815 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MRPL12P52815 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MRPL12P52815 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MRPL12P52815 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MRPL12P52815 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MRPL12P52815 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MRPL12P52815 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MRPL12P52815 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MRPL12P52815 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MRPL12P52815 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MRPL12P52815 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MRPL12P52815 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MRPL12P52815 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MRPL12P52815 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MRPL12P52815 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MRPL12P52815 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MRPL12P52815 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MRPL12P52815 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MRPL12P52815 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MRPL12P52815 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MRPL12P52815 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MRPL12P52815 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MRPL12P52815 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MRPL12P52815 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MRPL12P52815 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MRPL12P52815 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MRPL12P52815 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MRPL12P52815 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MRPL12P52815 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MRPL12P52815 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MRPL12P52815 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MRPL12P52815 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MRPL12P52815 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MRPL12P52815 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MRPL12P52815 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MRPL12P52815 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MRPL12P52815 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MRPL12P52815 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MRPL12P52815 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MRPL12P52815 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MRPL12P52815 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MRPL12P52815 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MRPL12P52815 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MRPL12P52815 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MRPL12P52815 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MRPL12P52815 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MRPL12P52815 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MRPL12P52815 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MRPL12P52815 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MRPL12P52815 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MRPL12P52815 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MRPL12P52815 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MRPL12P52815 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MRPL12P52815 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MRPL12P52815 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MRPL12P52815 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MRPL12P52815 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MRPL12P52815 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MRPL12P52815 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MRPL12P52815 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MRPL12P52815 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MRPL12P52815 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MRPL12P52815 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MRPL12P52815 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MRPL12P52815 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MRPL12P52815 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MRPL12P52815 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MRPL12P52815 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
MRPL12P52815 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
MRPL12P52815 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MRPL12P52815 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MRPL12P52815 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MRPL12P52815 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MRPL12P52815 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MRPL12P52815 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
MRPL12P52815 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MRPL12P52815 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.4
MRPL12P52815 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MRPL12P52815 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms