Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRE11P49959 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MRE11P49959 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRE11P49959 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRE11P49959 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRE11P49959 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MRE11P49959 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRE11P49959 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRE11P49959 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRE11P49959 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRE11P49959 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRE11P49959 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRE11P49959 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRE11P49959 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRE11P49959 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRE11P49959 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRE11P49959 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRE11P49959 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRE11P49959 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MRE11P49959 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRE11P49959 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRE11P49959 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRE11P49959 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRE11P49959 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRE11P49959 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRE11P49959 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
MRE11P49959 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRE11P49959 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRE11P49959 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRE11P49959 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRE11P49959 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRE11P49959 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRE11P49959 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRE11P49959 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRE11P49959 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRE11P49959 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRE11P49959 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRE11P49959 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MRE11P49959 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRE11P49959 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRE11P49959 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MRE11P49959 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRE11P49959 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRE11P49959 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRE11P49959 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRE11P49959 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRE11P49959 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MRE11P49959 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MRE11P49959 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MRE11P49959 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MRE11P49959 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MRE11P49959 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MRE11P49959 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MRE11P49959 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MRE11P49959 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MRE11P49959 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MRE11P49959 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MRE11P49959 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRE11P49959 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRE11P49959 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRE11P49959 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRE11P49959 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRE11P49959 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRE11P49959 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRE11P49959 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRE11P49959 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRE11P49959 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRE11P49959 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRE11P49959 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRE11P49959 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRE11P49959 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRE11P49959 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRE11P49959 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRE11P49959 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRE11P49959 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRE11P49959 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRE11P49959 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRE11P49959 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRE11P49959 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRE11P49959 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRE11P49959 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRE11P49959 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRE11P49959 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRE11P49959 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MRE11P49959 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MRE11P49959 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MRE11P49959 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MRE11P49959 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MRE11P49959 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MRE11P49959 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MRE11P49959 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRE11P49959 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MRE11P49959 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRE11P49959 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRE11P49959 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRE11P49959 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRE11P49959 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRE11P49959 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRE11P49959 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRE11P49959 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms