Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTBRP36941 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTBRP36941 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTBRP36941 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTBRP36941 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTBRP36941 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTBRP36941 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LTBRP36941 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTBRP36941 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTBRP36941 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTBRP36941 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTBRP36941 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTBRP36941 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTBRP36941 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTBRP36941 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTBRP36941 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTBRP36941 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTBRP36941 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTBRP36941 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
LTBRP36941 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTBRP36941 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTBRP36941 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
LTBRP36941 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTBRP36941 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTBRP36941 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTBRP36941 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTBRP36941 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTBRP36941 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTBRP36941 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTBRP36941 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTBRP36941 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LTBRP36941 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LTBRP36941 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LTBRP36941 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LTBRP36941 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LTBRP36941 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
LTBRP36941 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LTBRP36941 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LTBRP36941 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LTBRP36941 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
LTBRP36941 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LTBRP36941 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LTBRP36941 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LTBRP36941 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LTBRP36941 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LTBRP36941 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LTBRP36941 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LTBRP36941 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LTBRP36941 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LTBRP36941 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LTBRP36941 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LTBRP36941 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LTBRP36941 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LTBRP36941 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LTBRP36941 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LTBRP36941 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LTBRP36941 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LTBRP36941 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LTBRP36941 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LTBRP36941 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LTBRP36941 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LTBRP36941 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LTBRP36941 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LTBRP36941 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LTBRP36941 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LTBRP36941 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LTBRP36941 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LTBRP36941 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LTBRP36941 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LTBRP36941 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LTBRP36941 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LTBRP36941 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LTBRP36941 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LTBRP36941 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LTBRP36941 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LTBRP36941 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LTBRP36941 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LTBRP36941 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LTBRP36941 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LTBRP36941 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LTBRP36941 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LTBRP36941 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LTBRP36941 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LTBRP36941 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LTBRP36941 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LTBRP36941 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LTBRP36941 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LTBRP36941 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LTBRP36941 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LTBRP36941 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LTBRP36941 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LTBRP36941 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LTBRP36941 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LTBRP36941 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LTBRP36941 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LTBRP36941 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LTBRP36941 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LTBRP36941 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LTBRP36941 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LTBRP36941 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms