Protein–RNA interactions for Protein: P36578

RPL4, 60S ribosomal protein L4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL4P36578 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPL4P36578 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
RPL4P36578 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPL4P36578 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPL4P36578 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPL4P36578 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPL4P36578 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPL4P36578 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPL4P36578 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
RPL4P36578 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPL4P36578 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
RPL4P36578 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
RPL4P36578 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPL4P36578 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPL4P36578 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPL4P36578 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPL4P36578 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPL4P36578 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPL4P36578 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPL4P36578 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPL4P36578 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPL4P36578 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPL4P36578 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPL4P36578 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RPL4P36578 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPL4P36578 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPL4P36578 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPL4P36578 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPL4P36578 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RPL4P36578 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPL4P36578 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPL4P36578 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPL4P36578 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPL4P36578 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RPL4P36578 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPL4P36578 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RPL4P36578 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPL4P36578 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPL4P36578 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPL4P36578 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPL4P36578 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPL4P36578 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPL4P36578 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPL4P36578 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
RPL4P36578 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
RPL4P36578 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPL4P36578 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPL4P36578 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPL4P36578 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPL4P36578 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPL4P36578 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPL4P36578 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPL4P36578 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPL4P36578 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RPL4P36578 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPL4P36578 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPL4P36578 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPL4P36578 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPL4P36578 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPL4P36578 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPL4P36578 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPL4P36578 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RPL4P36578 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPL4P36578 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPL4P36578 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPL4P36578 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPL4P36578 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPL4P36578 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPL4P36578 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RPL4P36578 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RPL4P36578 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL4P36578 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL4P36578 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL4P36578 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL4P36578 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL4P36578 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL4P36578 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL4P36578 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL4P36578 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL4P36578 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL4P36578 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL4P36578 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL4P36578 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL4P36578 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL4P36578 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL4P36578 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL4P36578 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL4P36578 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL4P36578 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL4P36578 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL4P36578 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL4P36578 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL4P36578 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL4P36578 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL4P36578 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL4P36578 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL4P36578 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL4P36578 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL4P36578 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL4P36578 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms