Protein–RNA interactions for Protein: P35916

FLT4, Vascular endothelial growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT4P35916 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FLT4P35916 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FLT4P35916 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FLT4P35916 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FLT4P35916 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FLT4P35916 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FLT4P35916 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FLT4P35916 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FLT4P35916 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FLT4P35916 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FLT4P35916 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FLT4P35916 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FLT4P35916 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FLT4P35916 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FLT4P35916 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FLT4P35916 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FLT4P35916 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
FLT4P35916 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FLT4P35916 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FLT4P35916 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FLT4P35916 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FLT4P35916 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FLT4P35916 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FLT4P35916 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FLT4P35916 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FLT4P35916 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FLT4P35916 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FLT4P35916 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FLT4P35916 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FLT4P35916 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FLT4P35916 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FLT4P35916 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FLT4P35916 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FLT4P35916 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FLT4P35916 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FLT4P35916 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FLT4P35916 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FLT4P35916 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FLT4P35916 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FLT4P35916 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FLT4P35916 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FLT4P35916 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FLT4P35916 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FLT4P35916 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FLT4P35916 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FLT4P35916 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FLT4P35916 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
FLT4P35916 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FLT4P35916 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FLT4P35916 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FLT4P35916 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FLT4P35916 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FLT4P35916 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FLT4P35916 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FLT4P35916 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FLT4P35916 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FLT4P35916 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
FLT4P35916 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FLT4P35916 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FLT4P35916 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FLT4P35916 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FLT4P35916 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FLT4P35916 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
FLT4P35916 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FLT4P35916 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FLT4P35916 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FLT4P35916 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FLT4P35916 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
FLT4P35916 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FLT4P35916 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FLT4P35916 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FLT4P35916 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FLT4P35916 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FLT4P35916 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FLT4P35916 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FLT4P35916 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FLT4P35916 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FLT4P35916 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FLT4P35916 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FLT4P35916 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FLT4P35916 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FLT4P35916 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FLT4P35916 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FLT4P35916 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FLT4P35916 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FLT4P35916 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FLT4P35916 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FLT4P35916 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FLT4P35916 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FLT4P35916 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FLT4P35916 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FLT4P35916 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
FLT4P35916 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FLT4P35916 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FLT4P35916 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FLT4P35916 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FLT4P35916 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FLT4P35916 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FLT4P35916 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FLT4P35916 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms