Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TAF1P21675 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TAF1P21675 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TAF1P21675 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TAF1P21675 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TAF1P21675 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TAF1P21675 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TAF1P21675 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TAF1P21675 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TAF1P21675 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TAF1P21675 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TAF1P21675 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TAF1P21675 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TAF1P21675 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TAF1P21675 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TAF1P21675 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TAF1P21675 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TAF1P21675 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TAF1P21675 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TAF1P21675 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TAF1P21675 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TAF1P21675 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TAF1P21675 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TAF1P21675 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TAF1P21675 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TAF1P21675 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TAF1P21675 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TAF1P21675 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TAF1P21675 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TAF1P21675 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TAF1P21675 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TAF1P21675 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TAF1P21675 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TAF1P21675 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TAF1P21675 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TAF1P21675 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TAF1P21675 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TAF1P21675 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TAF1P21675 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TAF1P21675 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TAF1P21675 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TAF1P21675 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TAF1P21675 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TAF1P21675 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TAF1P21675 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TAF1P21675 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TAF1P21675 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TAF1P21675 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TAF1P21675 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TAF1P21675 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TAF1P21675 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TAF1P21675 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TAF1P21675 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TAF1P21675 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TAF1P21675 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TAF1P21675 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TAF1P21675 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TAF1P21675 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TAF1P21675 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TAF1P21675 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TAF1P21675 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TAF1P21675 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TAF1P21675 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TAF1P21675 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TAF1P21675 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TAF1P21675 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TAF1P21675 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TAF1P21675 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TAF1P21675 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TAF1P21675 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TAF1P21675 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TAF1P21675 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TAF1P21675 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TAF1P21675 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TAF1P21675 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TAF1P21675 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TAF1P21675 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TAF1P21675 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TAF1P21675 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TAF1P21675 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TAF1P21675 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TAF1P21675 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TAF1P21675 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TAF1P21675 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TAF1P21675 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TAF1P21675 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TAF1P21675 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TAF1P21675 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TAF1P21675 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TAF1P21675 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TAF1P21675 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TAF1P21675 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TAF1P21675 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TAF1P21675 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TAF1P21675 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TAF1P21675 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TAF1P21675 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TAF1P21675 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TAF1P21675 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TAF1P21675 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms