Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RGPD2P0DJD1 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RGPD2P0DJD1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RGPD2P0DJD1 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RGPD2P0DJD1 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RGPD2P0DJD1 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RGPD2P0DJD1 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RGPD2P0DJD1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RGPD2P0DJD1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RGPD2P0DJD1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RGPD2P0DJD1 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RGPD2P0DJD1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RGPD2P0DJD1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RGPD2P0DJD1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RGPD2P0DJD1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RGPD2P0DJD1 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RGPD2P0DJD1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RGPD2P0DJD1 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RGPD2P0DJD1 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RGPD2P0DJD1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RGPD2P0DJD1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RGPD2P0DJD1 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RGPD2P0DJD1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RGPD2P0DJD1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RGPD2P0DJD1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RGPD2P0DJD1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RGPD2P0DJD1 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RGPD2P0DJD1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RGPD2P0DJD1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RGPD2P0DJD1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RGPD2P0DJD1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RGPD2P0DJD1 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RGPD2P0DJD1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RGPD2P0DJD1 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RGPD2P0DJD1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
RGPD2P0DJD1 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RGPD2P0DJD1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RGPD2P0DJD1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RGPD2P0DJD1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RGPD2P0DJD1 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RGPD2P0DJD1 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RGPD2P0DJD1 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
RGPD2P0DJD1 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RGPD2P0DJD1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RGPD2P0DJD1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RGPD2P0DJD1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RGPD2P0DJD1 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RGPD2P0DJD1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RGPD2P0DJD1 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RGPD2P0DJD1 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RGPD2P0DJD1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
RGPD2P0DJD1 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RGPD2P0DJD1 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
RGPD2P0DJD1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RGPD2P0DJD1 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RGPD2P0DJD1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RGPD2P0DJD1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RGPD2P0DJD1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RGPD2P0DJD1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RGPD2P0DJD1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RGPD2P0DJD1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RGPD2P0DJD1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RGPD2P0DJD1 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RGPD2P0DJD1 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RGPD2P0DJD1 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
RGPD2P0DJD1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RGPD2P0DJD1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RGPD2P0DJD1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RGPD2P0DJD1 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RGPD2P0DJD1 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RGPD2P0DJD1 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RGPD2P0DJD1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RGPD2P0DJD1 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RGPD2P0DJD1 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
RGPD2P0DJD1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RGPD2P0DJD1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RGPD2P0DJD1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RGPD2P0DJD1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RGPD2P0DJD1 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RGPD2P0DJD1 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RGPD2P0DJD1 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RGPD2P0DJD1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RGPD2P0DJD1 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RGPD2P0DJD1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RGPD2P0DJD1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RGPD2P0DJD1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RGPD2P0DJD1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RGPD2P0DJD1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RGPD2P0DJD1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RGPD2P0DJD1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RGPD2P0DJD1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RGPD2P0DJD1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RGPD2P0DJD1 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RGPD2P0DJD1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RGPD2P0DJD1 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RGPD2P0DJD1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RGPD2P0DJD1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RGPD2P0DJD1 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RGPD2P0DJD1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RGPD2P0DJD1 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms