Protein–RNA interactions for Protein: P09493

TPM1, Tropomyosin alpha-1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM1P09493 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPM1P09493 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPM1P09493 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPM1P09493 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPM1P09493 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPM1P09493 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPM1P09493 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPM1P09493 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPM1P09493 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM1P09493 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM1P09493 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM1P09493 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM1P09493 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM1P09493 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM1P09493 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM1P09493 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM1P09493 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM1P09493 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM1P09493 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM1P09493 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM1P09493 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM1P09493 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM1P09493 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM1P09493 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM1P09493 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM1P09493 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM1P09493 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM1P09493 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM1P09493 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPM1P09493 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPM1P09493 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPM1P09493 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPM1P09493 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPM1P09493 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPM1P09493 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPM1P09493 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPM1P09493 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPM1P09493 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPM1P09493 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPM1P09493 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPM1P09493 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPM1P09493 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPM1P09493 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPM1P09493 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPM1P09493 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPM1P09493 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPM1P09493 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPM1P09493 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPM1P09493 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPM1P09493 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPM1P09493 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPM1P09493 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPM1P09493 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPM1P09493 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPM1P09493 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPM1P09493 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPM1P09493 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPM1P09493 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPM1P09493 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPM1P09493 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPM1P09493 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPM1P09493 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPM1P09493 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPM1P09493 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPM1P09493 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPM1P09493 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPM1P09493 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPM1P09493 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPM1P09493 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPM1P09493 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPM1P09493 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPM1P09493 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPM1P09493 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPM1P09493 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPM1P09493 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPM1P09493 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPM1P09493 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPM1P09493 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TPM1P09493 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TPM1P09493 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TPM1P09493 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TPM1P09493 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPM1P09493 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPM1P09493 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPM1P09493 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPM1P09493 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPM1P09493 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPM1P09493 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPM1P09493 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPM1P09493 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPM1P09493 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPM1P09493 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPM1P09493 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPM1P09493 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPM1P09493 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPM1P09493 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TPM1P09493 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPM1P09493 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPM1P09493 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPM1P09493 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms