Protein–RNA interactions for Protein: P02458

COL2A1, Collagen alpha-1(II) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL2A1P02458 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL2A1P02458 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
COL2A1P02458 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL2A1P02458 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL2A1P02458 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL2A1P02458 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL2A1P02458 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL2A1P02458 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL2A1P02458 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL2A1P02458 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL2A1P02458 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL2A1P02458 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL2A1P02458 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL2A1P02458 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL2A1P02458 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL2A1P02458 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL2A1P02458 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL2A1P02458 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL2A1P02458 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL2A1P02458 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL2A1P02458 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL2A1P02458 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL2A1P02458 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL2A1P02458 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL2A1P02458 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL2A1P02458 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL2A1P02458 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL2A1P02458 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COL2A1P02458 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COL2A1P02458 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
COL2A1P02458 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COL2A1P02458 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COL2A1P02458 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COL2A1P02458 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COL2A1P02458 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COL2A1P02458 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COL2A1P02458 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COL2A1P02458 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COL2A1P02458 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL2A1P02458 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL2A1P02458 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL2A1P02458 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL2A1P02458 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
COL2A1P02458 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL2A1P02458 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL2A1P02458 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL2A1P02458 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL2A1P02458 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
COL2A1P02458 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL2A1P02458 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
COL2A1P02458 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
COL2A1P02458 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
COL2A1P02458 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
COL2A1P02458 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
COL2A1P02458 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
COL2A1P02458 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
COL2A1P02458 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
COL2A1P02458 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
COL2A1P02458 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
COL2A1P02458 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
COL2A1P02458 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
COL2A1P02458 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
COL2A1P02458 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
COL2A1P02458 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL2A1P02458 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL2A1P02458 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL2A1P02458 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL2A1P02458 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL2A1P02458 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL2A1P02458 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL2A1P02458 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL2A1P02458 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL2A1P02458 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL2A1P02458 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
COL2A1P02458 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL2A1P02458 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL2A1P02458 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL2A1P02458 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
COL2A1P02458 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL2A1P02458 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL2A1P02458 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL2A1P02458 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL2A1P02458 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL2A1P02458 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL2A1P02458 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL2A1P02458 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL2A1P02458 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL2A1P02458 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL2A1P02458 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL2A1P02458 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL2A1P02458 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL2A1P02458 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL2A1P02458 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL2A1P02458 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
COL2A1P02458 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL2A1P02458 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL2A1P02458 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL2A1P02458 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL2A1P02458 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL2A1P02458 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms