Protein–RNA interactions for Protein: O95243

MBD4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD4O95243 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MBD4O95243 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MBD4O95243 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MBD4O95243 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MBD4O95243 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MBD4O95243 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MBD4O95243 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MBD4O95243 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
MBD4O95243 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MBD4O95243 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
MBD4O95243 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MBD4O95243 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MBD4O95243 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MBD4O95243 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MBD4O95243 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MBD4O95243 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MBD4O95243 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MBD4O95243 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MBD4O95243 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MBD4O95243 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MBD4O95243 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MBD4O95243 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MBD4O95243 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MBD4O95243 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MBD4O95243 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MBD4O95243 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MBD4O95243 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MBD4O95243 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MBD4O95243 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MBD4O95243 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MBD4O95243 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MBD4O95243 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MBD4O95243 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MBD4O95243 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MBD4O95243 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MBD4O95243 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MBD4O95243 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MBD4O95243 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MBD4O95243 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MBD4O95243 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MBD4O95243 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MBD4O95243 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MBD4O95243 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MBD4O95243 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MBD4O95243 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MBD4O95243 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MBD4O95243 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MBD4O95243 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MBD4O95243 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MBD4O95243 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MBD4O95243 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MBD4O95243 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MBD4O95243 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MBD4O95243 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MBD4O95243 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MBD4O95243 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MBD4O95243 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MBD4O95243 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MBD4O95243 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MBD4O95243 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MBD4O95243 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MBD4O95243 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MBD4O95243 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MBD4O95243 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MBD4O95243 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MBD4O95243 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MBD4O95243 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MBD4O95243 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MBD4O95243 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MBD4O95243 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MBD4O95243 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MBD4O95243 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MBD4O95243 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MBD4O95243 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MBD4O95243 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MBD4O95243 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MBD4O95243 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MBD4O95243 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MBD4O95243 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MBD4O95243 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MBD4O95243 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MBD4O95243 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MBD4O95243 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MBD4O95243 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MBD4O95243 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MBD4O95243 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MBD4O95243 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MBD4O95243 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MBD4O95243 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MBD4O95243 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MBD4O95243 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MBD4O95243 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MBD4O95243 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MBD4O95243 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MBD4O95243 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MBD4O95243 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MBD4O95243 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MBD4O95243 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MBD4O95243 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MBD4O95243 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms