Protein–RNA interactions for Protein: O43303

CCP110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCP110O43303 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCP110O43303 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCP110O43303 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCP110O43303 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCP110O43303 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCP110O43303 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCP110O43303 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCP110O43303 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCP110O43303 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCP110O43303 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCP110O43303 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCP110O43303 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCP110O43303 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCP110O43303 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCP110O43303 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCP110O43303 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCP110O43303 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCP110O43303 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCP110O43303 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCP110O43303 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCP110O43303 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCP110O43303 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCP110O43303 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCP110O43303 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCP110O43303 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCP110O43303 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCP110O43303 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCP110O43303 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCP110O43303 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCP110O43303 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCP110O43303 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCP110O43303 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCP110O43303 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCP110O43303 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCP110O43303 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCP110O43303 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCP110O43303 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCP110O43303 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCP110O43303 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCP110O43303 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCP110O43303 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCP110O43303 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCP110O43303 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCP110O43303 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCP110O43303 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCP110O43303 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCP110O43303 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCP110O43303 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCP110O43303 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCP110O43303 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCP110O43303 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCP110O43303 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCP110O43303 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCP110O43303 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCP110O43303 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCP110O43303 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCP110O43303 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCP110O43303 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCP110O43303 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCP110O43303 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCP110O43303 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCP110O43303 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCP110O43303 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCP110O43303 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCP110O43303 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
CCP110O43303 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCP110O43303 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCP110O43303 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCP110O43303 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCP110O43303 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCP110O43303 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCP110O43303 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCP110O43303 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCP110O43303 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCP110O43303 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCP110O43303 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCP110O43303 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCP110O43303 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCP110O43303 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCP110O43303 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCP110O43303 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCP110O43303 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCP110O43303 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCP110O43303 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCP110O43303 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCP110O43303 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCP110O43303 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCP110O43303 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCP110O43303 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCP110O43303 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCP110O43303 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCP110O43303 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCP110O43303 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCP110O43303 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCP110O43303 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCP110O43303 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCP110O43303 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCP110O43303 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCP110O43303 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCP110O43303 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms