Protein–RNA interactions for Protein: O43272

PRODH, Proline dehydrogenase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRODHO43272 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PRODHO43272 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRODHO43272 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRODHO43272 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRODHO43272 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRODHO43272 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRODHO43272 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRODHO43272 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRODHO43272 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRODHO43272 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRODHO43272 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRODHO43272 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRODHO43272 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRODHO43272 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRODHO43272 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRODHO43272 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRODHO43272 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRODHO43272 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRODHO43272 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRODHO43272 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRODHO43272 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRODHO43272 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRODHO43272 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRODHO43272 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRODHO43272 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRODHO43272 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRODHO43272 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRODHO43272 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRODHO43272 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRODHO43272 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRODHO43272 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRODHO43272 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRODHO43272 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRODHO43272 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRODHO43272 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRODHO43272 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRODHO43272 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRODHO43272 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRODHO43272 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRODHO43272 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRODHO43272 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRODHO43272 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRODHO43272 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRODHO43272 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRODHO43272 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRODHO43272 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRODHO43272 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRODHO43272 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRODHO43272 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRODHO43272 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRODHO43272 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRODHO43272 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRODHO43272 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRODHO43272 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRODHO43272 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRODHO43272 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRODHO43272 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRODHO43272 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRODHO43272 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRODHO43272 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRODHO43272 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRODHO43272 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRODHO43272 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRODHO43272 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRODHO43272 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRODHO43272 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRODHO43272 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRODHO43272 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRODHO43272 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRODHO43272 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRODHO43272 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRODHO43272 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRODHO43272 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRODHO43272 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRODHO43272 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRODHO43272 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRODHO43272 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRODHO43272 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRODHO43272 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRODHO43272 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRODHO43272 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRODHO43272 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRODHO43272 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRODHO43272 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRODHO43272 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRODHO43272 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PRODHO43272 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRODHO43272 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PRODHO43272 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRODHO43272 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRODHO43272 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRODHO43272 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRODHO43272 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PRODHO43272 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRODHO43272 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRODHO43272 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRODHO43272 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRODHO43272 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRODHO43272 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRODHO43272 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms