Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SYNJ2O15056 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SYNJ2O15056 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SYNJ2O15056 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SYNJ2O15056 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SYNJ2O15056 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SYNJ2O15056 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SYNJ2O15056 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SYNJ2O15056 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SYNJ2O15056 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SYNJ2O15056 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SYNJ2O15056 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
SYNJ2O15056 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SYNJ2O15056 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SYNJ2O15056 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SYNJ2O15056 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
SYNJ2O15056 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SYNJ2O15056 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SYNJ2O15056 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SYNJ2O15056 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SYNJ2O15056 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SYNJ2O15056 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
SYNJ2O15056 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
SYNJ2O15056 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC34.1■■■■□ 3.05
SYNJ2O15056 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SYNJ2O15056 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SYNJ2O15056 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SYNJ2O15056 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SYNJ2O15056 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SYNJ2O15056 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SYNJ2O15056 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
SYNJ2O15056 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SYNJ2O15056 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SYNJ2O15056 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SYNJ2O15056 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SYNJ2O15056 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
SYNJ2O15056 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SYNJ2O15056 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SYNJ2O15056 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SYNJ2O15056 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
SYNJ2O15056 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
SYNJ2O15056 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SYNJ2O15056 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
SYNJ2O15056 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
SYNJ2O15056 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
SYNJ2O15056 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
SYNJ2O15056 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
SYNJ2O15056 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
SYNJ2O15056 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
SYNJ2O15056 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
SYNJ2O15056 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
SYNJ2O15056 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
SYNJ2O15056 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC34.07■■■■□ 3.05
SYNJ2O15056 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC34.07■■■■□ 3.05
SYNJ2O15056 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
SYNJ2O15056 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
SYNJ2O15056 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
SYNJ2O15056 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
SYNJ2O15056 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
SYNJ2O15056 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
SYNJ2O15056 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
SYNJ2O15056 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
SYNJ2O15056 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SYNJ2O15056 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
SYNJ2O15056 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
SYNJ2O15056 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SYNJ2O15056 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SYNJ2O15056 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SYNJ2O15056 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
SYNJ2O15056 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
SYNJ2O15056 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SYNJ2O15056 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SYNJ2O15056 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
SYNJ2O15056 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
SYNJ2O15056 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SYNJ2O15056 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SYNJ2O15056 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SYNJ2O15056 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SYNJ2O15056 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SYNJ2O15056 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SYNJ2O15056 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SYNJ2O15056 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SYNJ2O15056 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SYNJ2O15056 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SYNJ2O15056 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
SYNJ2O15056 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
SYNJ2O15056 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SYNJ2O15056 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SYNJ2O15056 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SYNJ2O15056 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SYNJ2O15056 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SYNJ2O15056 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SYNJ2O15056 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SYNJ2O15056 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SYNJ2O15056 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SYNJ2O15056 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SYNJ2O15056 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SYNJ2O15056 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SYNJ2O15056 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
SYNJ2O15056 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms