Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQV1 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
H3BQV1 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
H3BQV1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
H3BQV1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
H3BQV1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
H3BQV1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
H3BQV1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
H3BQV1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
H3BQV1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
H3BQV1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
H3BQV1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
H3BQV1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
H3BQV1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
H3BQV1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
H3BQV1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
H3BQV1 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
H3BQV1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
H3BQV1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
H3BQV1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
H3BQV1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
H3BQV1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
H3BQV1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
H3BQV1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
H3BQV1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
H3BQV1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
H3BQV1 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
H3BQV1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
H3BQV1 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
H3BQV1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
H3BQV1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
H3BQV1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
H3BQV1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
H3BQV1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
H3BQV1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
H3BQV1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
H3BQV1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
H3BQV1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
H3BQV1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
H3BQV1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
H3BQV1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
H3BQV1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
H3BQV1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
H3BQV1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
H3BQV1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
H3BQV1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
H3BQV1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
H3BQV1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
H3BQV1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
H3BQV1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
H3BQV1 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
H3BQV1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
H3BQV1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
H3BQV1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
H3BQV1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
H3BQV1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
H3BQV1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
H3BQV1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
H3BQV1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
H3BQV1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
H3BQV1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
H3BQV1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
H3BQV1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
H3BQV1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
H3BQV1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
H3BQV1 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
H3BQV1 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
H3BQV1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
H3BQV1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
H3BQV1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
H3BQV1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
H3BQV1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
H3BQV1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
H3BQV1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
H3BQV1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
H3BQV1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
H3BQV1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
H3BQV1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
H3BQV1 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
H3BQV1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
H3BQV1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
H3BQV1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
H3BQV1 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
H3BQV1 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
H3BQV1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
H3BQV1 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
H3BQV1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
H3BQV1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
H3BQV1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
H3BQV1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
H3BQV1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
H3BQV1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
H3BQV1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
H3BQV1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
H3BQV1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
H3BQV1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
H3BQV1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
H3BQV1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
H3BQV1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
H3BQV1 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
H3BQV1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms