Protein–RNA interactions for Protein: A6NKD9

CCDC85C, Coiled-coil domain-containing protein 85C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85CA6NKD9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC85CA6NKD9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC85CA6NKD9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC85CA6NKD9 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC85CA6NKD9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC85CA6NKD9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC85CA6NKD9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC85CA6NKD9 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC85CA6NKD9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC85CA6NKD9 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC85CA6NKD9 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC85CA6NKD9 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC85CA6NKD9 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC85CA6NKD9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC85CA6NKD9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC85CA6NKD9 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC85CA6NKD9 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC85CA6NKD9 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC85CA6NKD9 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC85CA6NKD9 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC85CA6NKD9 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC85CA6NKD9 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC85CA6NKD9 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC85CA6NKD9 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC85CA6NKD9 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms