Protein–RNA interactions for Protein: A6NDK9

GOLGA6C, Golgin subfamily A member 6C, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6CA6NDK9 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA6CA6NDK9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms