Protein–RNA interactions for Protein: A4D1N5

Putative uncharacterized protein FLJ40288, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4D1N5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
A4D1N5 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
A4D1N5 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
A4D1N5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
A4D1N5 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
A4D1N5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
A4D1N5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
A4D1N5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
A4D1N5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
A4D1N5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
A4D1N5 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
A4D1N5 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
A4D1N5 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
A4D1N5 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
A4D1N5 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
A4D1N5 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
A4D1N5 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
A4D1N5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
A4D1N5 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
A4D1N5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
A4D1N5 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
A4D1N5 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
A4D1N5 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
A4D1N5 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
A4D1N5 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
A4D1N5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
A4D1N5 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
A4D1N5 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
A4D1N5 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
A4D1N5 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
A4D1N5 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
A4D1N5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
A4D1N5 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
A4D1N5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
A4D1N5 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
A4D1N5 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
A4D1N5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
A4D1N5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
A4D1N5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
A4D1N5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
A4D1N5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
A4D1N5 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC14□□□□□ -0.17
A4D1N5 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
A4D1N5 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
A4D1N5 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
A4D1N5 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC14□□□□□ -0.17
A4D1N5 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
A4D1N5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
A4D1N5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
A4D1N5 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
A4D1N5 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
A4D1N5 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC14□□□□□ -0.17
A4D1N5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
A4D1N5 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
A4D1N5 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
A4D1N5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
A4D1N5 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
A4D1N5 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
A4D1N5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
A4D1N5 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
A4D1N5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
A4D1N5 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
A4D1N5 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
A4D1N5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
A4D1N5 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
A4D1N5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
A4D1N5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
A4D1N5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
A4D1N5 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
A4D1N5 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
A4D1N5 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
A4D1N5 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
A4D1N5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
A4D1N5 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
A4D1N5 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
A4D1N5 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
A4D1N5 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
A4D1N5 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
A4D1N5 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
A4D1N5 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
A4D1N5 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
A4D1N5 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
A4D1N5 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
A4D1N5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
A4D1N5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
A4D1N5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
A4D1N5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
A4D1N5 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
A4D1N5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
A4D1N5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
A4D1N5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
A4D1N5 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
A4D1N5 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
A4D1N5 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
A4D1N5 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
A4D1N5 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
A4D1N5 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
A4D1N5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
A4D1N5 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
A4D1N5 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms