Protein–RNA interactions for Protein: A0A0K0K1E9

TRBV7-7, T-cell receptor beta variable 7-7 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-7A0A0K0K1E9 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRBV7-7A0A0K0K1E9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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TRBV7-7A0A0K0K1E9 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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TRBV7-7A0A0K0K1E9 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRBV7-7A0A0K0K1E9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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