Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 C1QTNF3-AMACR-201ENST00000382079 3424 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 FTSJ3-201ENST00000427159 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 ADAR-201ENST00000368471 6515 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 TNC-203ENST00000423613 6281 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 ANGEL2-202ENST00000366962 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 APC2-203ENST00000535453 11656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 SEC22B-201ENST00000578049 6922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 HPS5-206ENST00000531848 2160 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 MAT2B-202ENST00000321757 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 ANKRD55-203ENST00000504958 2139 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 RAET1E-207ENST00000532335 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 GLRA1-201ENST00000274576 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 TTC1-201ENST00000231238 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 BCORL1-205ENST00000540052 7127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 PGCP1-202ENST00000436252 1358 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 THRB-AS1-205ENST00000609230 1318 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 MPHOSPH6-201ENST00000258169 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 IL31-201ENST00000377035 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 DCTN3-204ENST00000378913 951 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 MIR885-201ENST00000401316 74 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 MAPRE3-202ENST00000402218 1001 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 RN7SKP7-201ENST00000410540 285 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 RDH11-202ENST00000428130 1064 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 AC005105.1-201ENST00000454851 792 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 AL135902.1-201ENST00000458017 384 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 IGKV1-6-201ENST00000464162 380 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 IGKV1-9-201ENST00000493819 409 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 IGKV1-5-201ENST00000496168 532 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 LINC02219-201ENST00000520762 454 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 AC022733.1-201ENST00000521257 739 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 IGLVI-56-201ENST00000521342 342 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 AC008770.1-208ENST00000591838 430 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 GPX2-205ENST00000612794 1084 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 IGHV3-54-201ENST00000622166 353 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 AC116348.4-201ENST00000624127 348 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 LINC00969-266ENST00000626156 683 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 AC135068.9-201ENST00000628927 355 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 URB2-201ENST00000258243 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 XRCC2-201ENST00000359321 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 FBXL2-222ENST00000538892 2793 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 VAPB-204ENST00000475243 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 SSBP3-AS1-201ENST00000361350 2624 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 RANGAP1-207ENST00000455915 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 TIAM2-203ENST00000360366 5771 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 FRY-202ENST00000380250 10688 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 FRY-209ENST00000642040 10697 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 AK3-204ENST00000611749 4029 ntTSL 4 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 SEC61A2-204ENST00000379020 2252 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 ZBTB20-203ENST00000462705 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 HERC2P2-201ENST00000613386 5181 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 TRIM55-201ENST00000276573 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 LSMEM1-201ENST00000312849 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 SLC8A1-205ENST00000405901 3139 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 TMEM178B-202ENST00000565468 10558 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 TMEM178B-203ENST00000610315 10552 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 AC097382.2-201ENST00000500031 4300 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 ERCC5-202ENST00000375954 2986 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 LIAS-222ENST00000640888 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 TRERF1-203ENST00000372917 3914 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 GPR55-202ENST00000392040 3828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 PLXNA4-202ENST00000359827 13786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 ZSCAN29-202ENST00000396976 5595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 AC012508.1-201ENST00000564121 4476 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 SLAMF7-204ENST00000441662 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 MAPK10-361ENST00000641862 2462 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 CLDN18-202ENST00000343735 3434 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 LINC01806-202ENST00000439050 2333 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 ADGRE3-202ENST00000344373 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 CTAGE5-203ENST00000341502 4091 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 CD48-202ENST00000368046 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 SHC3-201ENST00000375831 569 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 CRYZL1-206ENST00000413017 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 TPI1P1-201ENST00000420977 750 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 AL358176.4-201ENST00000428891 675 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 OR4D8P-201ENST00000431137 930 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 AC108868.1-201ENST00000431411 554 ntTSL 4 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 TUBB4BP3-201ENST00000437546 271 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 BSN-AS1-201ENST00000442384 461 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 UBQLN4P2-201ENST00000446233 948 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 FDPSP2-201ENST00000453932 897 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 AC108865.1-201ENST00000507644 496 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 ENPP7P8-203ENST00000529093 317 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 AC044839.2-201ENST00000531982 534 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 PGA5-205ENST00000541528 867 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 MIR4695-201ENST00000577305 74 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 H3F3B-204ENST00000586607 551 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 AC002116.2-201ENST00000586962 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 AC020905.1-201ENST00000587777 575 ntTSL 4 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 AC007228.1-201ENST00000600036 142 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 AC135068.10-201ENST00000638015 913 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 AP001120.1-201ENST00000561598 3710 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 CYFIP1-203ENST00000610365 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 HIPK1-203ENST00000369553 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 CLDN18-201ENST00000183605 3520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 NGRN-202ENST00000379095 7237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 NMT1-201ENST00000258960 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 SLTM-202ENST00000380516 4147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 FNIP2-201ENST00000264433 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 KLF17-201ENST00000372299 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LMO3Q8TAP4 P2RX7-202ENST00000328963 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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