Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT0

TTC7A, Tetratricopeptide repeat protein 7A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7AQ9ULT0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TTC7AQ9ULT0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TTC7AQ9ULT0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TTC7AQ9ULT0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TTC7AQ9ULT0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TTC7AQ9ULT0 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TTC7AQ9ULT0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TTC7AQ9ULT0 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TTC7AQ9ULT0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TTC7AQ9ULT0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms