Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFMBT1Q9UHJ3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SFMBT1Q9UHJ3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SFMBT1Q9UHJ3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SFMBT1Q9UHJ3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SFMBT1Q9UHJ3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SFMBT1Q9UHJ3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SFMBT1Q9UHJ3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SFMBT1Q9UHJ3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SFMBT1Q9UHJ3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SFMBT1Q9UHJ3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SFMBT1Q9UHJ3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SFMBT1Q9UHJ3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFMBT1Q9UHJ3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFMBT1Q9UHJ3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFMBT1Q9UHJ3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFMBT1Q9UHJ3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFMBT1Q9UHJ3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFMBT1Q9UHJ3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFMBT1Q9UHJ3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFMBT1Q9UHJ3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFMBT1Q9UHJ3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFMBT1Q9UHJ3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFMBT1Q9UHJ3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFMBT1Q9UHJ3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFMBT1Q9UHJ3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFMBT1Q9UHJ3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFMBT1Q9UHJ3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFMBT1Q9UHJ3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SFMBT1Q9UHJ3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFMBT1Q9UHJ3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFMBT1Q9UHJ3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFMBT1Q9UHJ3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFMBT1Q9UHJ3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SFMBT1Q9UHJ3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms