Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHG2

PCSK1N, ProSAAS, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1NQ9UHG2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCSK1NQ9UHG2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCSK1NQ9UHG2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCSK1NQ9UHG2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCSK1NQ9UHG2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCSK1NQ9UHG2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCSK1NQ9UHG2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCSK1NQ9UHG2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCSK1NQ9UHG2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PCSK1NQ9UHG2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCSK1NQ9UHG2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCSK1NQ9UHG2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCSK1NQ9UHG2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCSK1NQ9UHG2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCSK1NQ9UHG2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCSK1NQ9UHG2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCSK1NQ9UHG2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCSK1NQ9UHG2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCSK1NQ9UHG2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCSK1NQ9UHG2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCSK1NQ9UHG2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCSK1NQ9UHG2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCSK1NQ9UHG2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCSK1NQ9UHG2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCSK1NQ9UHG2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCSK1NQ9UHG2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCSK1NQ9UHG2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCSK1NQ9UHG2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCSK1NQ9UHG2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCSK1NQ9UHG2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCSK1NQ9UHG2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCSK1NQ9UHG2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCSK1NQ9UHG2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCSK1NQ9UHG2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCSK1NQ9UHG2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCSK1NQ9UHG2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCSK1NQ9UHG2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCSK1NQ9UHG2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCSK1NQ9UHG2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCSK1NQ9UHG2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCSK1NQ9UHG2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCSK1NQ9UHG2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCSK1NQ9UHG2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCSK1NQ9UHG2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PCSK1NQ9UHG2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCSK1NQ9UHG2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCSK1NQ9UHG2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCSK1NQ9UHG2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCSK1NQ9UHG2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCSK1NQ9UHG2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCSK1NQ9UHG2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCSK1NQ9UHG2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PCSK1NQ9UHG2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCSK1NQ9UHG2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCSK1NQ9UHG2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCSK1NQ9UHG2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCSK1NQ9UHG2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCSK1NQ9UHG2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PCSK1NQ9UHG2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCSK1NQ9UHG2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCSK1NQ9UHG2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCSK1NQ9UHG2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCSK1NQ9UHG2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCSK1NQ9UHG2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCSK1NQ9UHG2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCSK1NQ9UHG2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PCSK1NQ9UHG2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCSK1NQ9UHG2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCSK1NQ9UHG2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCSK1NQ9UHG2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCSK1NQ9UHG2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCSK1NQ9UHG2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PCSK1NQ9UHG2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PCSK1NQ9UHG2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCSK1NQ9UHG2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCSK1NQ9UHG2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCSK1NQ9UHG2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCSK1NQ9UHG2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCSK1NQ9UHG2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCSK1NQ9UHG2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCSK1NQ9UHG2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCSK1NQ9UHG2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCSK1NQ9UHG2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCSK1NQ9UHG2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCSK1NQ9UHG2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCSK1NQ9UHG2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCSK1NQ9UHG2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCSK1NQ9UHG2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCSK1NQ9UHG2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCSK1NQ9UHG2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCSK1NQ9UHG2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCSK1NQ9UHG2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCSK1NQ9UHG2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCSK1NQ9UHG2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCSK1NQ9UHG2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCSK1NQ9UHG2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCSK1NQ9UHG2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCSK1NQ9UHG2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCSK1NQ9UHG2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCSK1NQ9UHG2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms