Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGV2

NDRG3, Protein NDRG3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDRG3Q9UGV2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDRG3Q9UGV2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms