Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRY4

ARHGAP35, Rho GTPase-activating protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP35Q9NRY4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
ARHGAP35Q9NRY4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
ARHGAP35Q9NRY4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
ARHGAP35Q9NRY4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ARHGAP35Q9NRY4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ARHGAP35Q9NRY4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ARHGAP35Q9NRY4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
ARHGAP35Q9NRY4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ARHGAP35Q9NRY4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC33.08■■■□□ 2.89
ARHGAP35Q9NRY4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
ARHGAP35Q9NRY4 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ARHGAP35Q9NRY4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC33.08■■■□□ 2.89
ARHGAP35Q9NRY4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ARHGAP35Q9NRY4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ARHGAP35Q9NRY4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ARHGAP35Q9NRY4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
ARHGAP35Q9NRY4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
ARHGAP35Q9NRY4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.89
ARHGAP35Q9NRY4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
ARHGAP35Q9NRY4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
ARHGAP35Q9NRY4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
ARHGAP35Q9NRY4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
ARHGAP35Q9NRY4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
ARHGAP35Q9NRY4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
ARHGAP35Q9NRY4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
ARHGAP35Q9NRY4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
ARHGAP35Q9NRY4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
ARHGAP35Q9NRY4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
ARHGAP35Q9NRY4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
ARHGAP35Q9NRY4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
ARHGAP35Q9NRY4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
ARHGAP35Q9NRY4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
ARHGAP35Q9NRY4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
ARHGAP35Q9NRY4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
ARHGAP35Q9NRY4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
ARHGAP35Q9NRY4 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
ARHGAP35Q9NRY4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
ARHGAP35Q9NRY4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
ARHGAP35Q9NRY4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
ARHGAP35Q9NRY4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
ARHGAP35Q9NRY4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
ARHGAP35Q9NRY4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
ARHGAP35Q9NRY4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
ARHGAP35Q9NRY4 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
ARHGAP35Q9NRY4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC33.05■■■□□ 2.88
ARHGAP35Q9NRY4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
ARHGAP35Q9NRY4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
ARHGAP35Q9NRY4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
ARHGAP35Q9NRY4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
ARHGAP35Q9NRY4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
ARHGAP35Q9NRY4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
ARHGAP35Q9NRY4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
ARHGAP35Q9NRY4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
ARHGAP35Q9NRY4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
ARHGAP35Q9NRY4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
ARHGAP35Q9NRY4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
ARHGAP35Q9NRY4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
ARHGAP35Q9NRY4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
ARHGAP35Q9NRY4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
ARHGAP35Q9NRY4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
ARHGAP35Q9NRY4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
ARHGAP35Q9NRY4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
ARHGAP35Q9NRY4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
ARHGAP35Q9NRY4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
ARHGAP35Q9NRY4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
ARHGAP35Q9NRY4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
ARHGAP35Q9NRY4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
ARHGAP35Q9NRY4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
ARHGAP35Q9NRY4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
ARHGAP35Q9NRY4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
ARHGAP35Q9NRY4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
ARHGAP35Q9NRY4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
ARHGAP35Q9NRY4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
ARHGAP35Q9NRY4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.88
ARHGAP35Q9NRY4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.88
ARHGAP35Q9NRY4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
ARHGAP35Q9NRY4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
ARHGAP35Q9NRY4 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC33.01■■■□□ 2.88
ARHGAP35Q9NRY4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
ARHGAP35Q9NRY4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
ARHGAP35Q9NRY4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
ARHGAP35Q9NRY4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
ARHGAP35Q9NRY4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
ARHGAP35Q9NRY4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
ARHGAP35Q9NRY4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
ARHGAP35Q9NRY4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
ARHGAP35Q9NRY4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
ARHGAP35Q9NRY4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
ARHGAP35Q9NRY4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
ARHGAP35Q9NRY4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC33■■■□□ 2.87
ARHGAP35Q9NRY4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
ARHGAP35Q9NRY4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
ARHGAP35Q9NRY4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
ARHGAP35Q9NRY4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
ARHGAP35Q9NRY4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
ARHGAP35Q9NRY4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
ARHGAP35Q9NRY4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
ARHGAP35Q9NRY4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
ARHGAP35Q9NRY4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
ARHGAP35Q9NRY4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms