Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB9BQ9NP90 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms